南京工程學院是二本院校。

根據(jù)近年南京工程學院在各地錄取批次得知，南京工程學院在河南、安徽等省為第一批次錄取，因此通常認為南京工程學院是一本大學；而在四川、貴州、陜西、寧夏、廣西、江西、黑龍江、山西、甘肅、云南等省是第二批次招生，因此又可以說南京工程學院是二本院校。綜上所述。

南京工程學院在各省招生批次不同，在江蘇是本科一批招生，我們可以說南京工程學院是一本大學。在江蘇以外，南京工程學院是本科二批招生，也可以說南京工程學院是二本大學。