區(qū)別如下：

一、性質(zhì)不同：

1、學生會是學校黨委領導下、團委指導下的主要學生組織。

2、團總支是中國共青團的總支部委員會，是在黨委和共青團團委領導下的青年團總支部委員會。

二、基本任務不同：

1、學生會維護校規(guī)校紀，倡導良好的校風、學風，促進同學之間、同學與教職員工之間的團結。協(xié)助學校建設良好的教學秩序和學習、生活環(huán)境；組織同學開展有益于成長成才的自我服務活動，協(xié)助學校解決同學在學習和生活中遇到的實際問題等。

2、團總支主持召開團支部書記會議，傳達黨總支和上級團組織的指示精神和決議，研究和部署團總支的各項工作任務；主持制定團總支工作計劃并要定期總結團總支工作，經(jīng)常向黨總支和上級團組織反映情況，匯報和請示工作等。