食品微生物學（food microbiology），是微生物學的分支學科，主要研究微生物與食品制造、保藏等方面內(nèi)容的一門科學。

該學科涉及病毒、細菌、真菌多種微生物，除研究這些微生物的一般生物學特性外，還探討它們與食品有關的特性。

隨著微生物學及生命科學的迅速發(fā)展，食品微生物學也從中獲得了許多新的知識和新的技術，并應用這些新知識和新技術來生產(chǎn)更多富有營養(yǎng)和安全的食品。